青海省农林科学院-凯发k8一触即发

近日，青海大学“青海省昆仑英才农业科技创新团队（青藏高原昆虫生态与害虫防治团队）”来有鹏课题组，在nature旗下期刊scientific data上发表了“genome assembly of the grassland caterpillar  gynaephora qinghaiensis ”一文。

草原毛虫（lepidoptera： lymantriinae：gynaephora）是一个小型昆虫类群，全世界记录有15个物种，分布在北极冻土带和北半球的高海拔地区。在中国，所有8个被命名的gynaephora物种都栖息在海拔2900至5000米的青藏高原地区。草原毛虫是青藏高原高寒草甸最具破坏性的害虫，它们不仅取食牧草，导致严重的饲草短缺和草地退化，还会引起家畜和野生动物的口腔黏膜溃疡。

研究组就青海草原毛虫（ gynaephora qinghaiensis ）的基因组进行了组装。组装后的基因组大小为861.04 mb，由107个contig组成，contig n50大小为18.65 mb。busco分析显示，组装体中含有99.56%（99.27%完整，0.29%片段化）的busco基因。在 g. qinghaiensis 基因组中，预测有580.2 mb（占基因组的67.4%）的重复序列和16 618个蛋白质编码基因。系统发育基因组学分析表明， g. qinghaiensis 与锈色卷蛾 orgyia antiqua 大约在1830万年前分化。此外，基因家族进化分析表明，在 g. qinghaiensis 基因组中，有130个基因家族显著扩张，43个基因家族收缩。参考基因组的可用性可为揭示草原毛虫对高海拔环境的适应性进化机制提供遗传资源。同时，有助于制定草原毛虫的综合防控策略。该研究得到了青海省科技厅重点研发与转化计划专项（2023nk152）和青海省昆仑英才专项的支持。